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感染性疾病嚴(yán)重威脅人類健康，快速、精準(zhǔn)的病原微生物診斷成為臨床的迫切需求。隨著分子生物檢測技術(shù)的發(fā)展，病原微生物檢測手段也得到快速升級。近年來，高通量基因測序技術(shù)在臨床病原體檢測中開始大放光彩。宏基因組測序 (mNGS) 技術(shù)的應(yīng)用開啟了感染病原診斷的新篇章，能夠無預(yù)設(shè)、無偏倚地檢測上萬種病原微生物，尤其適用于疑難危重、免疫缺陷或疑似感染新發(fā)、罕見病原體等特殊患者的病原診斷。病原靶向測序 (tNGS) 技術(shù)基于超多重PCR擴增技術(shù)或探針雜交捕獲技術(shù)對目標(biāo)病原體進(jìn)行富集，再結(jié)合高通量測序技術(shù)，能夠?qū)Υ郎y樣本中幾百至上千種已知病原微生物及其耐藥和/或毒力基因進(jìn)行檢測。與病原宏基因組測序 (mNGS) 相比，tNGS具有病原譜范圍明確、靈敏度高、測序成本低等優(yōu)勢，在病原檢測領(lǐng)域受到越來越多的關(guān)注。

呼吸道感染是臨床最常見的感染性疾病之一，其中下呼吸道感染 (主要包括肺炎和氣管/支氣管炎) 發(fā)病率高達(dá)6.3%，是全球第4大致死原因，在5歲以下兒童死因中位列首位，占所有死亡病例的13.32%[1]。呼吸道感染病原譜包括細(xì)菌、病毒、真菌、支原體、衣原體等多種類型，病原體種類多樣、變異頻繁，且存在混合感染情況。及時明確呼吸道感染患者的病原體類型，對于進(jìn)一步診療工作具有至關(guān)重要的作用。因此，進(jìn)行及時準(zhǔn)確的病原學(xué)診斷，盡早確定目標(biāo)病原并進(jìn)行針對性用藥治療，是改善患者預(yù)后、降低病死率和后遺癥發(fā)生率的關(guān)鍵。

2023年8月，華大基因推出了PTseqTM呼吸道感染病原微生物靶向高通量基因檢測產(chǎn)品，其基于超多重PCR靶向擴增技術(shù)結(jié)合高通量測序，一次檢測200余種靶標(biāo)，可覆蓋臨床95%以上的呼吸道感染常見核心病原體及重點耐藥基因和毒力基因，兼具優(yōu)越的檢測性能與高性價比。全方位助力個體化抗感染治療方案的制定，降低耐藥發(fā)生風(fēng)險，助力感染精準(zhǔn)診療。

本次，華大基因正式發(fā)布PTseqTM呼吸道感染病原微生物靶向高通量基因檢測本地化方案，助力院內(nèi)病原tNGS精準(zhǔn)檢測實驗室建設(shè)，為臨床提供高效、精準(zhǔn)、快速、經(jīng)濟(jì)的感染病原高通量測序檢測服務(wù)，實現(xiàn)感染精準(zhǔn)診療。

產(chǎn)品介紹

檢測范圍：全面覆蓋274種靶標(biāo) (檢測范圍升級)，包括232種呼吸道感染癥候群常見病原體、31種耐藥基因和11種毒力基因。

適用人群：疑似呼吸道感染患者。

樣本類型：適用于肺泡灌洗液、鼻咽/口咽拭子、痰液等樣本類型。

技術(shù)優(yōu)勢 ：

（1) 全方位防污染體系，讓污染無處遁形：

• 每輪 PCR 均引入樣本唯一標(biāo)簽，通過生信流程精準(zhǔn)識別和矯正，嚴(yán)控批次內(nèi)交叉污染風(fēng)險。
• 引入熱敏 UDG 酶防污染技術(shù)，清除 PCR 殘余產(chǎn)物，從源頭阻斷批次間污染。

（2) 核心引物設(shè)計系統(tǒng)，助力病原體高效擴增：

• 臨床級別微生物序列數(shù)據(jù)庫累積，確保精準(zhǔn)選擇病原體特異性區(qū)域。
• 高效引物設(shè)計算法，確保引物序列在病原體種內(nèi)共有率高，種間特異性強。
• 多靶點引物設(shè)計，保障病原靶標(biāo)高效擴增，避免脫靶。

產(chǎn)品優(yōu)勢

01 極速檢測周期：搭配極速測序平臺，全流程檢測周期低至10小時。

02 檢測性能優(yōu)異：高效擴增體系+精準(zhǔn)分析流程，保障檢測性能

• 高效檢測真菌/RNA病毒等難檢靶標(biāo)，真菌檢出靈敏度可達(dá)91.4%，RNA病毒檢測靈敏度可達(dá)98%；
• 病原體檢測限低至50 copies/mL。

03 可與mNGS靈活混樣：MGISEQ-2000、MGISEQ-200、DNBSEQ-G99等多種測序平臺均可實現(xiàn)與mNGS的混樣上機，滿足臨床需求，解決湊樣難題。

04 全方位防污染體系：源頭阻斷+精準(zhǔn)識別，從根源解決污染問題，降低檢測結(jié)果假陽性率。

本地化全流程解決方案

華大基因PTseqTM呼吸道感染病原微生物靶向高通量基因檢測，提供從樣本處理到數(shù)據(jù)分析所需的儀器、試劑、軟件全流程整體解決方案。

• 多款測序平臺靈活滿足不同臨床需求

• PTseqTM院內(nèi)檢測本地化檢測流程：采用配套樣本制備系統(tǒng)完成樣本處理和文庫構(gòu)建后，可根據(jù)實際需求選擇不同通量測序平臺進(jìn)行測序，并通過全自動分析解讀一體機進(jìn)行生信分析、解讀和報告發(fā)放，輕松一站式在本地實現(xiàn)PTseqTM從樣本處理到分析報告全流程。

其中，采用極速小型測序儀 DNBSEQ-E25，搭載封閉式微流控樣本制備系統(tǒng) DNBelab-D4，可實現(xiàn)從樣本到報告的全流程自動化。

PTseqTM呼吸道感染病原微生物靶向高通量基因檢測項目基于tNGS技術(shù)，提供本地化全流程解決方案，一站式輕松檢測；搭載多款國產(chǎn)測序平臺，滿足不同應(yīng)用場景需求；全面防污染體系，嚴(yán)格保障檢測質(zhì)量；支持混樣，靈活高效、經(jīng)濟(jì)實用。兼顧廣度、深度、精度，推動病原高通量檢測技術(shù)的本地化臨床應(yīng)用，助力感染性疾病精準(zhǔn)診療發(fā)展！

結(jié)語

華大基因作為病原微生物高通量測序領(lǐng)域的領(lǐng)先企業(yè)，以感染防控基礎(chǔ)研究及臨床應(yīng)用服務(wù)為核心，堅持創(chuàng)新和差異化戰(zhàn)略，不斷加強和完善感染精準(zhǔn)診斷全場景的系列產(chǎn)品布局；技術(shù)涵蓋宏基因組技術(shù)、靶向測序技術(shù)、多重PCR技術(shù)等，逐漸形成了針對疑難未知病原感染患者、常規(guī)住院患者、門急診患者的多場景全覆蓋的產(chǎn)品體系；建立從社區(qū)感染到院內(nèi)復(fù)雜感染的全套本地化產(chǎn)品解決方案，助力臨床對感染性疾病進(jìn)行針對性治療，最大程度降低患者死亡率，協(xié)助醫(yī)生合理用藥，助力感染性疾病的精準(zhǔn)治愈。

參考資料：

[1] Global Burden of Disease Collaborative Network. Global Burden of Disease Study 2019 (GBD 2019) Results. Seattle, United States: Institute for Health Metrics and Evaluation (IHME), 2020.